Theo Văn phòng Ủy ban Ứng phó sự cố, thiên tai và tìm kiếm cứu nạn (Cục Cứu hộ cứu nạn, Bộ Quốc phòng), đến 17h30 ngày 7/9, đã ghi nhận nhiều sự cố, tai nạn trên biển khiến một số thuyền viên đang mất tích do chịu ảnh hưởng bão số 3 Yagi.
Tại Quảng Ninh, tàu Tiến Thành 05 (tàu cần cẩu, của Công ty cổ phần thương mại Logistic Quảng Ninh) neo tránh trú bão tại Vũng Đục - Cẩm Phả (Quảng Ninh) bị mất tích cùng 7 thuyền viên. Các tàu Tiến Thành 02, Tiến Thành 03 cũng thuộc công ty trên, bị trôi dạt, mắc kẹt tại Cung Cá Heo (TP.Hạ Long). Trên mỗi phương tiện có khoảng 10 người.
Tàu kéo biển Hồng Gai (thuộc Công ty cổ phần cảng Quảng Ninh) khi neo tránh bão tại khu vực Hang Bồ Nâu có 7 thuyền viên, đã bị mất tích.
Sau khi sự cố xảy ra, tàu lai Hạ Long 08 đã vớt được 1 thi thể, 6 thuyền viên còn lại của tàu kéo biển Hồng Gai vẫn đang mất tích.
Còn tại Hải Phòng, một tàu cá không rõ tên bị hỏng máy, trên tàu có 1 người, trôi dạt tại khu vực hòn Vạn Bội - Cát Bà, đến thời điểm báo cáo, không liên lạc được với tàu. Gần vị trí tàu bị nạn có tàu CSB9004, cách 6 hải lý, sẵn sàng cơ động đi tìm kiếm cứu nạn. Tuy nhiên, do thời tiết xấu, tàu CSB9004 vẫn chưa tiếp cận được tàu bị nạn.
Ngoài ra, tại Hải Phòng đang mất điện trên diện rộng. Tại Quảng Ninh, nhiều mái nhà, biển hiệu tốc mái, hư hỏng nặng; 5 tàu vỏ xi măng, 1 tàu vỏ gỗ chìm tại khu neo đậu âu cảng Cô Tô; một số tàu thuyền trôi dạt khỏi các khu vực neo đậu.
Cũng theo Cục Cứu hộ cứu nạn, đã có 383.672 người (74.030 bộ đội, 284.054 dân quân tự vệ) đã huy động và 5.318 phương tiện, gồm 313 xe đặc chủng, 3.412 xe ô tô, 1.589 tàu, xuồng và 4 máy bay tham gia ứng trực, triển khai công tác ứng phó, khắc phục hậu quả của mưa bão.