Tài liệu điều tra cho thấy, Tạ Duy Khanh có quan hệ quen biết với chị H.Y.N. (17 tuổi, ở Hà Nội). Ngày 10/10/2023, Khanh đưa chị N. về nhà ở xã Đa Tốn, huyện Gia Lâm, Hà Nội. Khi vào phòng khách, hai người xảy ra mâu thuẫn.
Khanh đã dùng dao nhọn đâm nhiều nhát vào ngực nạn nhân rồi phân xác, cho thi thể vào thùng xốp mang đi phi tang tại khu vực sông Hồng thuộc địa phận xã Bát Tràng, Gia Lâm, Hà Nội.
Đến khoảng 23h ngày 14/10/2023, Công an Hà Nội bắt giữ Tạ Duy Khanh khi đang lẩn trốn tại nhà riêng ở Thái Bình. Quá trình bị vây bắt, Khanh dùng dao tự sát nhưng không thành.
Giai đoạn điều tra, bị can khai, mâu thuẫn giữa chị N. và anh ta xuất phát từ việc, khoảng giữa năm 2022, Khanh cho chị N. vay 60 triệu đồng, đòi nhiều lần nhưng chị N. không trả.
Còn đối với lái xe taxi được Khanh nhờ cùng bê thùng xốp đựng thi thể chị N, tài liệu điều tra cho thấy, người này không biết Khanh mang thùng xốp xuống sông Hồng để phi tang thi thể nạn nhân. Do vậy, Cơ quan điều tra không xem xét xử lý đối với lái xe taxi.
Tài liệu tố tụng cho rằng, bị cáo phạm tội với nhiều tình tiết định khung như thực hiện tội phạm một cách man rợ, có tính chất côn đồ, ngay sau đó lại thực hiện một tội phạm rất nghiêm trọng hoặc tội phạm đặc biệt nghiêm trọng…