Việc kiêm nhiệm này thực hiện sự phân công của Ban Cán sự Đảng, Bộ trưởng Y tế.
Ông Thuấn hiện là một trong bốn Thứ trưởng Bộ Y tế. Ông cũng là Phó Chủ tịch phụ trách, điều hành Hội đồng Y khoa Quốc gia; Phó Trưởng ban Bảo vệ, Chăm sóc sức khỏe cán bộ Trung ương; Phó Chủ tịch Tổng hội Y học Việt Nam.
Trước khi là Thứ trưởng Bộ Y tế vào tháng 5/2020, GS.TS Trần Văn Thuấn là Giám đốc Bệnh viện K.
Đây không phải lần đầu một thứ trưởng Bộ Y tế kiêm nhiệm phụ trách, điều hành một bệnh viện tuyến Trung ương. Năm 2010, GS Nguyễn Viết Tiến được bổ nhiệm làm Thứ trưởng Bộ Y tế, vừa là Giám đốc Bệnh viện Phụ sản Trung ương (đến năm 2013). Ông Tiến cũng có thời gian phụ trách điều hành Bệnh viện Việt Đức.
Bệnh viện Việt Đức thành lập năm 1902, là một trong 6 bệnh viện hạng Đặc biệt của cả nước (cùng với Bệnh viện Bạch Mai, 108, Chợ Rẫy, Trung ương Huế, Trung ương Thái Nguyên), đồng thời là bệnh viện ngoại khoa hàng đầu Việt Nam.
Mỗi năm, cơ sở y tế này phẫu thuật từ 70.000 tới 80.000 trường hợp bệnh nhân nặng, cấp cứu. Trung bình mỗi ngày, bệnh viện tiếp nhận khoảng 2.000 bệnh nhân nội trú và khoảng 2.000 người đến khám.