Các bị can Lương Văn Hóa (cựu TGĐ Công ty CP Dược phẩm Cửu Long), Nguyễn Thanh Tòng (cựu Phó TGĐ), Nguyễn Thanh Hải (nguyên kế toán trưởng) và Ngô Hiếu Nghĩa (nguyên Giám đốc chi nhánh TP.HCM) bị truy tố tội Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Bị can Cao Minh Quang (cựu Thứ trưởng Bộ Y tế), Dương Huy Liệu (cựu Vụ Trưởng Vụ Kế hoạch Tài chính), Nguyễn Việt Hùng (cựu Cục phó Cục Quản lý Dược), Phạm Thị Minh Nga (cựu chuyên viên Vụ Kế hoạch Tài chính Bộ Y tế, nguyên Kế toán trưởng Ban quản lý thực hiện kế hoạch phòng chống dịch cúm A (H1N1), Bộ Y tế) và Nguyễn Nam Liên (nguyên Phó Vụ Trưởng Vụ Kế hoạch Tài chính Bộ Y tế, Phó trưởng ban quản lý thực hiện kế hoạch phòng chống dịch cúm A (H1N1), Bộ Y tế) bị truy tố tội Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng.
Theo cáo buộc, thực hiện kế hoạch dự trữ thuốc Tamiflu và sản xuất thuốc Oseltamivir phòng chống dịch cúm A/H5N1 tại Việt Nam, Thủ tướng Chính phủ trên cơ sở thông báo giá thành sản xuất thuốc Oseltamivir của Bộ Tài chính, Bộ y tế, đã giao kế hoạch và đặt hàng Công ty CP Dược Cửu Long sản xuất thuốc trên từ nguồn nguyên liệu nhập khẩu, theo hình thức ký và thực hiện các hợp đồng kinh tế.
Theo quy định về quản lý giá hàng hóa, dịch vụ do Nhà nước đặt hàng sản xuất bằng nguồn ngân sách Nhà nước, Công ty CP Dược Cửu Long phải chấp hành cơ chế quản lý giá và các mức giá do cơ quan Nhà nước có thẩm quyền quy định.
Quá trình thực hiện kế hoạch sản xuất thuốc, Công ty CP Dược Cửu Long được giảm giá mua nguyên liệu, nhưng với động cơ vụ lợi, bị can Lương Văn Hóa đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn, chỉ đạo việc hạch toán trái nguyên tắc kế toán; lập thư giãn nợ để che giấu việc kiểm tra, thanh tra; đồng thời chỉ đạo việc hợp thức hồ sơ thanh toán che giấu nhằm giữ lại số tiền giảm giá mua nguyên liệu hơn 3,8 triệu USD (tương đương hơn 61 tỷ đồng) để sử dụng, gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước.
Trong vụ án này, ông Cao Minh Quang với tư cách Trưởng ban chỉ đạo giải quyết những vấn đề liên quan đến thuốc Tamiflu và Oseltamivir đã ký quyết định thành lập đoàn kiểm tra liên ngành kiểm tra tình hình mua, bảo quản, sử dụng thuốc.
Cáo trạng cho rằng, khi được báo cáo về việc Công ty CP Dược Cửu Long chưa thanh toán cho nhà cung cấp hơn 3 triệu USD, đồng thời cả Bộ Tài chính và Bộ Y tế đều có chỉ đạo kiểm tra đối với số tiền này, nhưng ông Quang đã không chỉ đạo kiểm tra, làm rõ.
Theo lời khai của ông Quang tại CQĐT, khi được Bộ Y tế chỉ đạo kiểm tra số tiền hơn 3,8 triệu USD, ông đã giao Cục Quản lý Dược tổng hợp ý kiến để báo cáo Thủ tướng, nhưng Cục Quản lý Dược không làm theo. Do bận nhiều việc, bị can không đề xuất hay giao đơn vị có chức năng kiểm tra tiếp.
Vẫn theo lời khai của cựu Thứ trưởng Bộ Y tế, việc kiểm tra tài chính là nhiệm vụ của Thứ trưởng Bộ Y tế phụ trách tài chính, không thuộc nhiệm vụ của mình. Dù vậy, ông thừa nhận có thiếu sót khi không thực hiện đầy đủ nhiệm vụ, chức trách được giao.
Ông Quang có đơn gửi cơ quan điều tra và VKS xác nhận sai phạm, đồng thời tự nguyện nộp 1,5 tỉ đồng để khắc phục hậu quả.